2014年9月26日，市立医院被批准为国家级住院医师规范化培训（简称住培）基地，并由国家卫生计生委办公厅通过《关于公布第一批住院医师规范化培训基地名录的通知》予以公布。

2016年6月22日，省评估专家一行到医院检查住培工作

住培管理  2014年11月，国家级住培管理工作移交至科教部。12月13日，制定《菏泽市立医院住院医师规范化培训实施细则》，2015年9月22日，省住院医师规范化培训中心领导及督导专家对市立医院住培工作进行评估检查。2016年3月15日，医院印发《关于成立菏泽市立医院住院医师规范化培训委员会的通知》《关于成立菏泽市立医院规培基地技能培训小组的通知》及《菏泽市立医院规陪基地住院医师规范化培训管理办法》，院长赵利华任主任委员，副院长张全忠任副主任委员，各专业基地负责人及各行政职能部门负责人任委员，明确职责，统筹管理住院医师规范化培训工作，办公室设在科研教学部，田桂荣任办公室主任，张雁、时文馨、高巧会任专职管理员。管理办法包括“师资管理办法”“考核管理办法”“经费管理办法”3部分。4月，制定《菏泽市立医院基地住院医师规范化培训人事管理规定》；6月3日，印发《关于成立菏泽市立医院规培专业基地专职教学主任的通知》，设置17个专业基地教学主任；制定《菏泽市立医院住院医师规范化培训基地协同管理办法》，加强与协同单位的管理与协作。

2016年6月，“山东省住院医师规范化信息管理平台”正式投入使用，9月，开始为住培医师提供免费住宿。

2016年6月29日，住院医师规技能培训

师资培训与考核  2015年5月18日，菏泽市卫计委发文《关于表彰2014—2015年度优秀临床带教老师的通知》，对医院55名带教老师进行表彰。2016年3月15日，医院印发《菏泽市立医院规陪基地住院医师规范化培训管理办法》，科教部根据“师资管理办法”，通过申报、培训、遴选及考核，评出508名优秀带教老师组成师资库，并有计划的安排培训学习；成立10个“规培基地技能培训小组”，培训项目包括：心肺复苏、胸腔穿刺、腹腔穿刺、腰椎穿刺、骨髓穿刺、机械通气、气管插管、导尿术、体格检查和临床思维，并开展师资的培训与考核，对考核合格人员授予师资证书。7月18日，菏泽市卫计委发文《关于表彰2015—2016年度优秀临床带教老师的通知》，对医院56名带教老师进行表彰。